CIAT Genetic Resources Articles in National Journals

Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/10568/80735

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    Estudios del comportamiento fisiológico de la semilla de granadilla (Passiflora ligularis Juss.) para la conservación ex situ
    (Journal Article, 2012) Posada, Paula; Ocampo, John; Santos, Luís Guillermo
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    Patrones de diversidad genética y domesticación en frijol tepary (Phaseolus acutifolius Asa Gray)
    (Journal Article, 1997) Flórez R., Claudia P.; Debouck, Daniel G.; Gutiérrez, Ariel
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    Estudio de deterioro de semilla en condiciones controladas de conservación.
    (Journal Article, 2001) Cardozo, Carlos Iván; Guevara Gómez, Claudia Lucero; López, Yamel
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    First report of sugarcane mosaic virus in achira (Canna edulis Ker.) in Nariño, Colombia
    (Journal Article, 2020) Betancourt, Carlos; Salomón, Carlos; Montaño, Santiago; Salazar, Claudia; Uribe, Pedro; Martínez, Angélica; Muñoz, Lucely; Cuervo Ibáñez, Maritza
    Achira (Canna edulis Ker.) is a cultivated species for handcrafted food products and starch production. In Colombia is estimated an achira cultivated area of 800 ha; in the department of Nariño there has been a disturbance of viral etiology, known by farmers as Streak Virus, due to its symptoms in the leaves, but without previous records in the area. The disease causes losses in performance, although they have not been established precisely. In order to clarify the nature of this pathology and the identity of the pathogen associated with the problem, an investigation was carried out at the University of Nariño, by means of molecular tests of PCR and RT-PCR, sequencing, serology and electron microscopy, of foliar samples collected in the producing areas. The most outstanding symptoms in affected tissues were yellow mosaic, mottled, chlorotic streak and ribs discoloration, among others. There were no cytoplasmic inclusions similar to those produced by Potyvirus, nor viral particles were observed, nor serology positive results, but it was possible to achieve the amplifi cation of a cDNA fragment, with specific primers for Potyvirus and 98% of homology of the sequences with Sugarcane mosaic virus. This is the first SCMV report in achira in Nariño, Colombia.
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    Caracterización morfo-anatómica y protocolo para estimar la viabilidad de semillas de Psidium guajava
    (Journal Article, 2020) Guevara Ohara, Jorge Ernesto; Cardozo Conde, Carlos Iván; Santos Meléndez, Luís Guillermo
    Most research on P. guajava has been oriented to analyze nutritional composition of the fruits and some are related to the use of pre-germinative treatments for the release of seed dormancy in some genetic materials. However, no protocols have been developed that allow the determination of the viability of the seed; by using tetrazolium as an indicator. For the morpho-anatomical characterization of the P. guajava seed, four varieties of great economic importance for the CORPOICA Germplasm Bank were analyzed (Palmira ICA I, Cimpa Pulpa Roja, Manzana and Cl-0440A). A factorial test was performed to determine the concentration of Tetrazolium, exposure time and temperature effects. Guava seeds have a hard consistency testa, which is not an impediment to the imbibition process. The seed exhibits different forms (oboved, dentate, nailed, oblong, ovoid and reniform). The embryo is peripheral and has its fully developed structures at the time of seed extraction of fruits that have physiological maturity. The diameters, thickness and unit weight (g/100 seeds) of the guava seed vary according to the variety, which is probably related to the number of seeds contained in each fruit. The knowledge of the concentration and exposure time of the seeds to the Tetrazolium is of paramount importance for the evaluation of the physiological quality of the seed. A concentration of 0.1% for 12 hours of exposure under temperature conditions 26 ± 2 ° C and 40% relative humidity and 1% for 3 hours of exposure under controlled temperature conditions 40 ° C allows unambiguous assessment of physiology quality of the seed of this species.
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    Polimorfismo isoenzimático corrobora clasificación etnobotánica y distribución de la diversidad de yuca en Colombia
    (Journal Article, 1996) Giraldo Zapata, Martha C.; Ocampo Nahar, César H.; Bravo, Enrique; Bonierbale, Merideth W.; Debouck, Daniel G.
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    Integración de datos etnohistóricos y moleculares como herramienta en el estudio de la domesticación: Caso del frijol común (Phaseolus vulgaris L.) en el territorio Muisca, Colombia
    (Journal Article, 1996) Chacón Sánchez, María I.; Osorio C., Esteban; González, Alma Viviana; Beebe, Stephen E.; Debouck, Daniel G.
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    Acceso, seguimiento y control de los recursos genéticos en Colombia = Access, follow-up and control of genetic resources in Colombia
    (Journal Article, 2007) Torres Rojas, Esperanza; Torres, Ricardo; Debouck, Daniel G.
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    La prueba ELISA en semillas de frijol y su relación con la bioactividad del virus del mosaico común del frijol (BCMV)
    (Journal Article, 1996) Bravo Otero, Nelson; Pineda López, Benjamín; Hidalgo H, Rigoberto
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    Comparacion de tres metodos de la tecnica inmunoenzimatica ELISA para el diagnostico del virus del mosaico comun de la yuca
    (Journal Article, 1990) Velasco, Ana Cecilia; Nolt, Barry L.; Pineda López, Benjamín
    Con el proposito de obtener metodos de diagnostico rapido del virus del mosaico comun de la yuca (CCMV) que faciliten el intercambio de germoplasma de yuca (Manihot esculenta Crantz) con menores riesgos cuarentenarios, se compararon tres variaciones de la tecnica ELISA: la del doble emparedado (DAS-ELISA), y las indirectas con fijacion del antigeno al plato (PTA-ELISA) y de fragmentos F(a,b('))2. Los resultados obtenidos demostraron que con el metodo PTA-ELISA se obtenia informacion en menos de 4 horas con la misma sensibilidad de los otros dos metodos, lo cual representaba un ahorro significativo de tiempo en comparacion con las 36 horas promedio requeridas para realizar DAS-ELISA y F(a,b(')2-ELISA. (RA)
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    Introgresión mesoamericana en el germoplasma de habichuela (Phaseolus vulgaris L.) de centros secundarios de domesticación
    (Journal Article, 2004) Tofiño Rivera, Adriana Patricia; García, Víctor H.
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    Sistema de información móvil para procesos de producción de semillas en bancos de recursos genéticos, caso de estudio CIAT
    (Journal Article, 2016) González Monroy, Diego Fernando; Hernández Arbeláez, Angela Marcela; Machuca Villegas, Liliana Esther
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    Caracterización parcial de un Potexvirus aislado de Musa coccinea afectada por rayado necrótico en Colombia
    (Journal Article, 2008) Reichel, Helena; Cuervo Ibáñez, Maritza; Morales, Francisco J.
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    Centrosema brasilianum (L.) Benth.: Descripcion de la especie y evaluacion agronomica de siete ecotipos
    (Journal Article, 1986) Belalcázar, John Eiver; Schultze-Kraft, Rainer
    Se describen las principales caracteristicas morfologicas de Centrosema brasilianum, una leguminosa forrajera que se adapta bien a las condiciones edaficas y climaticas en los tropicos de America, y se hace una evaluacion agronomica de 7 ecotipos seleccionados. C. brasilianum es una leguminosa enredadera perenne que tiene un habito de crecimiento rastrero o trepador. Las hojas son trifoliadas y varian en tamano y forma segun el ecotipo. Las flores son papilionadas y pueden ser de color azul, morada, violeta, o menos frecuentemente blanca; se presentan tipicamente en racimos y cada inflorescencia tiene entre 2-5 flores, aunque a veces puede tener 14 flores. El fruto es una legumbre lineal deshiscente que contiene hasta 23 semillas. Algunas de las caracteristicas de la planta que se pueden utilizar para distinguir C. brasilianum de otras especies de Centrosema, son las bracteolas grandes (hasta 50 por ciento o mas del tamano de un foliolo) y el pedunculo floral hirsuto-piloso. Los 7 ecotipos de C. brasilianum escogidos para la prueba de evaluacion agronomica incluyeron la accesion CIAT 5234 (BRA-006025)que habia sido recolectada originalmente en un amplio rango de condiciones ecologicas diferentes en Arauca (Colombia), Sucre y Anzoategui (Venezuela) y Amazonas y Bahia (Brasil). Habian sido seleccionados previamente en viveros de introduccion con base en el vigor de la planta y su resistencia a enfermedades. Las evaluaciones se basaron en la produccion de MS y el valor nutritivo y se realizaron por un periodo de 2 anos en un Ultisol (pH 4.0, 6.0 por ciento de MO, 3.2 ppm de P, 85 por ciento de saturacion de Al) en la estacion CIAT-Quilichao (Cauca, Colombia). (Extracto)
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    Observaciones preliminares sobre el efecto In Vitro de bacterias antagónicas sobre el desarrollo de hongos aislados de semillas de Brachiaria brizantha
    (Journal Article, 2003) Balcázar, María del Socorro; Rivera, Angela Liliana; Pineda López, Benjamín
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    Presencia de la enfermedad del mal de azúcar (Sphacelia spp.) en tres especies del pasto Brachiaria (Panicoidea, Poaceae)
    (Journal Article, 2001) García, S.X.; Pineda López, Benjamín; Salazar Erazo, Sandra Milena
    El incremento y refrescamiento del germoplasma del Brachiaria se realiza, bajo condiciones de campo, en la estación Santa Rosa en las cercanías de Popayán por ser una localidad en donde la producción de semilla es buena. Sin embargo las condiciones de precipitación (más de 2000mm) y temperatura (16-24°C) de la localidad también favorecen el desarrollo de enfermedades de origen fungoso que afectan la producción de semilla. En un estudio de reconocimiento de dichas enfermedades, durante el segundo semestre de 1999 y el primero de 2000, al comienzo de la floración se observó sobre los racimos flora les una enfermedad caracterizada por la presencia de un exudado de consistencia viscosa y posterior recubrimiento de las semillas por fructificaciones de hongos, en algunos casos de color blanco y en otros rosado, gris verdoso o negro. Las observaciones de campo en las parcelas de multiplicación de las especies Brachiaria brizantha, Brachiaria decumbens y Brachiaria jubata permitieron determinar que la enfermedad afectaba las inflorescencias con diferentes grados de severidad. Los estudios realizados en el Laboratorio de Sanidad de Germoplasma (LSG) de la Unidad de Recursos Genéticos URG), consistentes en estudio microscópico de los exudados, cultivo en PDA, aislamiento a partir de flores afectadas y pruebas de patogenicidad permitieron determinar que la enfermedad era el mal de azúcar ocasionado por una especie de Sphacelia, hongo que presenta varios tipos de conidias de diferentes tamaños y formas, que incluyen conidias ovaladasI(3,76x5,2?m, piriformes (14,04x5,5I?m) o esféricas (4,64?m). Las fructificaciones fúngicas coloreadas, según los análisis de laboratorio, correspondían a fructificaciones de los hongos Cerebella sp. (Epicoccum sp.), Cladosporium sp., y Fusarium sp.. Por otra parte, para verificar la asociación de Sphacelia sp. con las semillas, se recolectaron muestras de 18 accesiones de B. brizantha , siete de B. decumbens y cinco de B. jubata. Las semillas se acondicionaron según los procedimientos establecidos en la URG para el germoplasma de gramíneas y se les realizó análisis de sanidad en el laboratorio utilizando el método de enjuague, el cual incluye la obtención de una suspensión de conidias, centrifugación y observación al microscopio, obteniéndose resultados positivos para la mayoría de las accesiones estudiadas. = The increase and regeneration of Brachiaria germplasm are carried out, under field conditions at "Santa Rosa" Experimental station near Popayan where the seed production conditions are relatively good. Nevertheless under the conditions of precipitation (more than 2000mm) and temperature (16-24 °C) of this location the production of seeds can be affected by fungal diseases. In a fungal diseases survey, during the second semester of 1999 and the first of the 2000, a honeydew oozing was observed on flowers when flowering was starting. Later the apparition of fungal growths of white color, black, green or pink in individual or combined form was observed on the affected seeds. The field observations on Brachiaria brizantha, Brachiaria decumbens and Brachiaria jubata multiplication plots allowed to determine that the disease affected the inflorescences with several grades of severity. The studies carried out in the Germplasm Health Laboratory (GHL) of the Genetic Resources Unit (GRU), consistent in a microscopic study of the oozed, cultivation in PDA and isolation starting from affected flowers, and pathogenicity tests allowed to determine that affection was the Honeydew disease occasioned by a species of Sphacelia. This pathogen produced conidia of several size and form, some of them (macroconidia): oval (13.76 x 5.2 ?u), pyriform (14,04 x 5,51?m) or spherical microconidia (4.64 m?). The colored fungal fructifications according to the laboratory analysis were classified as Cerebella sp., (Epicoccum sp.), Cladosporium sp., y Fusarium sp. In order to verify the association of Sphacelia sp. with the seeds, seed samples of 18 accesions of B. brizantha, seven of B. decumbens and five of B. jubata were gathered. The seeds were conditioned according to the procedures established in the GRU for the gramìnae germplasm and carried out their analysis of seed health in the GHL using washing test in order to verify the presence of Sphacelia conidia on seeds. The obtained results showed that the studied seed accessions were contaminated by Sphacelia spp.
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    Reconocimiento de enfermedades fungosas transmitidas por semilla en germoplasma de Brachiaria spp
    (Journal Article, 2000) García, S.X.; Pineda López, Benjamín
    El germoplasma del género Brachiaria que se conserva en la Unidad de Recursos Genéticos en el CIAT y que comprende más de 700 accesiones de 27 especies es regenerado e incrementado en Popayán (20° 25 n; 76° 40 w), en donde se desconoce la microflora que suele afectar la producción de semilla, requiriéndose así información fitopatológica al respecto. El presente estudio se realizó para determinar cual o cuales hongos transmitidos por semillas se encontraban afectando el proceso de incremento de las especies Brachiaria brizantha, Brachiaria decumbens y Brachiaria jubata. Se seleccionaron para el efecto muestras de semillas de B. brizuntha, B. decumbens y B. jubata, cosechadas en Popayán durante 1998 y el primer semestre de 1999, y conservadas en el secador de aire frío. Las muestras se acondicionaron debidamente y se les realizaron en el laboratorio los análisis respectivos, utilizando los métodos de PDA-Ac, cámara húmeda ( Blotter test ) e identificación mediante observaciones al esterosco pío y/o microscopio óptico. Los resultados obtenidos mostraron que las accesiones de las tres especies del estudio se encontraban afectadas por hongos de los géneros AIternaria spp., Aspergillus spp., Curvularia spp., Chaetomium spp.. Drechslera Spp., Cladosporium spp., Epiccocum spp., Nigrospora spp., Penicillium spp., Phoma spp. y otros no identificados; determinándose que Drechslera spp. y Phoma spp. fueron los de mayor incidencia. Los análisis mediante cámara húmeda mostraron que en las especies B. brizantha y B. decumbens la incidencia de Drechslera spp. fue del 11,25% y 9,14%, mientras que para Phoma sp. correspondió al 7,75% y 5.57%. En B. jubata la incidencia de Phoma sp., fue del 8.1% y el de Drechslera spp 1,3%. En los análisis mediante el método siembra en medio de cultivo PDA-Ac para B. brizantha se determinó que Dreschslera spp. y Phoma spp. Presentaron incidencia del 5,89 % y 12,33%; del 6.86% y 9.07% en B. decumbens y del 0.3% y 5.6% para B. jubata, respectivamente. Las pruebas de patogenicidad con Drechslera spp. y Phoma spp., realizadas en plántulas y cariópsides de las accesiones de B. brizantha y B. decumbens y no en B. jubata por no obtención de plantas, mostraron que dichos hongos ocasionaron infecciones en plántulas y redujeron la germinación, afectando la calidad fitosanitaria de las semillas; revistiendo por lo tanto importancia cuarentenaria, especialmente para actividades relacionadas con la distribución del germoplasma. = The Brachiaria germplasm collection maintained in CIAT, contains more than 700 accessions of 27 identified species. The process of regeneration and increase of germplasm is carried out in Popayán (2° 25 N; 76° 40 W) under field conditions. There is little available information about Brachiaria seed-borne fungal diseases, requiring phytopathological information to the reference, reason for the who was carried out the present study to establish the kind of fungi transmitted by seeds affecting the process of the increasing of the species Brachiaria brizantha, Brachiaria decumbens and Brachiaria jubata. For this research seed samples of B. brizantha, B. decumbens and B. jubata. harvested in Popayán during 1998 and the first semester of 1999, and conserved in the dryer of cold air were selected. The samples were conditioned properly and carried out them analysis of seed health in the laboratory using a blotter test and agar plate methods, and identification of the fungi by means of microscopical analysis. The gotten outputs showed that the used accesions of the three species of Brachiaria were affected by the fungi as Alternaria sp., Aspergillus sp., Curvularia spp., Chaetomium spp., Drechslera spp., Cladosporium spp., Epiccocum spp., Nigrospora spp., Penicillium spp., Phoma spp., and another unidentified fungi. The measured fungi incidence showed that Drechslera spp., and Phoma spp. were the high incidence fungi observed. In the B. brizantha species and B. decumbens met, in the analysis by means of humid camera, that the incidence of Drechslera spp. it was from the 11.25% and 9.14%, while for Phoma spp. it returned at 7.75% and 5.57%. In B. jubata the incidence of Phoma spp, it you was from the 8.1% and the of Drechslera spp. 1,3%. In the analysis by means of the agar plate method (PDA-Ac) for B. brizantha was determined that Dreschlera spp. and Phoma spp., showed an incidence of the 5,89% and 12.33%, of the 6.86% and 9.07% in B. decumbens and of the 0.3% and 5.6% for B. jubata, respectively. Pathogenicity test with Drechslera spp. and Phoma spp., which were the fungi with high incidence, caused severe symptoms in seedlings. The result of this study should be important for determining the risk of these fungi in the safe movement of Brachiaria germplasm.