Caractérisation de la diversité génétique des bactéries Xanthomonas phaseoli pv. manihotis et Xanthomonas cassavae en RD Congo

cg.authorship.typesCGIAR and advanced research instituteen
cg.contributor.affiliationCatholique Universite de Louvainen
cg.contributor.crpRoots, Tubers and Bananas
cg.contributor.donorUnited States Agency for International Developmenten
cg.coverage.countryCongo, Democratic Republic of
cg.coverage.iso3166-alpha2CD
cg.coverage.regionAfrica
cg.coverage.regionWest and Central Africa
cg.howPublishedFormally Publisheden
cg.identifier.iitathemeBIOTECH & PLANT BREEDING
cg.identifier.urlhttp://hdl.handle.net/2078.1/thesis:49175en
cg.placeLouvain, Belgiumen
cg.subject.iitaAGRONOMYen
cg.subject.iitaBIODIVERSITYen
cg.subject.iitaCASSAVAen
cg.subject.iitaDISEASE CONTROLen
cg.subject.iitaFOOD SECURITYen
cg.subject.iitaPLANT BREEDINGen
cg.subject.iitaPLANT DISEASESen
cg.subject.iitaPLANT PRODUCTIONen
cg.subject.impactAreaNutrition, health and food security
cg.subject.impactPlatformNutrition, Health and Food Security
cg.subject.sdgSDG 2 - Zero hungeren
dc.contributor.authorLuzolo Tulomba, A.en
dc.date.accessioned2025-01-21T08:24:50Zen
dc.date.available2025-01-21T08:24:50Zen
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10568/169524
dc.titleCaractérisation de la diversité génétique des bactéries Xanthomonas phaseoli pv. manihotis et Xanthomonas cassavae en RD Congofr
dcterms.abstractLe manioc est l'une des principales cultures en République Démocratique du Congo, malheureusement il est affecté par divers agents pathogènes. Cette étude a exploré la diversité génétique des souches de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) et Xanthomonas cassavae (Xc) en utilisant initialement la technique d'amplification de l'ARNr 16S pour confirmer l'identité des souches, puis la méthode MLVA (Multi-Locus Variable number tandem repeat Analysis) pour comparer les souches récentes aux anciennes souches du laboratoire SAVE, isolées en RD Congo dans les années 1970. La technique MLVA a permis de mettre en évidence la diversité au sein des souches comparées, tout en montrant certaines limites, notamment dans la comparaison des souches Lomami6 et UPB008, qui ont présenté des profils similaires. Le séquençage du génome entier de ces deux souches particulières a ensuite permis d'obtenir des informations plus précises. Les résultats ont confirmé que Lomami6 n'est pas une Xanthomonas cassavae, mais plutôt une Xanthomonas phaseoli pv. manihotis, tandis que UPB008 est effectivement une Xanthomonas cassavae. Par contre, aucun isolat de l’espèce Xanthomonas cassavae n’a pu être mise en évidence dans les souches récentes. Les résultats montrent que LOMAMI6 se rapproche de souches isolées en Colombie, au Nigeria et en Ouganda, tandis que UPB008 est génétiquement distinct des autres génomes de Xanthomonas cassavae déjà publiés sur la base des données NCBI. Les informations génomiques obtenues dans cette étude enrichissent notre compréhe...en
dcterms.accessRightsOpen Access
dcterms.audienceScientistsen
dcterms.bibliographicCitationLuzolo Tulomba, A. (2024). Caractérisation de la diversité génétique des bactéries Xanthomonas phaseoli pv. manihotis et Xanthomonas cassavae en RD Congo. Louvain, Belgium: Universite Catholique de Louvain, (74 p.).en
dcterms.descriptionIITA supervisor: Dr. M. Sikirouen
dcterms.extent74 p.en
dcterms.issued2024
dcterms.languagefr
dcterms.licenseCC-BY-NC-4.0
dcterms.publisherUniversite Catholique de Louvainen
dcterms.subjectcassavaen
dcterms.subjectgenetic diversityen
dcterms.subjectxanthomonas campestris phaseolien
dcterms.subjectdisease controlen
dcterms.subjectplant breedingen
dcterms.subjectplant diseasesen
dcterms.subjectplant productionen
dcterms.typeThesis

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