Caractérisation de la diversité génétique des bactéries Xanthomonas phaseoli pv. manihotis et Xanthomonas cassavae en RD Congo

cg.authorship.typesCGIAR and advanced research instituteen_US
cg.contributor.affiliationCatholique Universite de Louvainen_US
cg.contributor.crpRoots, Tubers and Bananasen_US
cg.contributor.donorUnited States Agency for International Developmenten_US
cg.coverage.countryCongo, Democratic Republic ofen_US
cg.coverage.iso3166-alpha2CDen_US
cg.coverage.regionAfricaen_US
cg.coverage.regionWest and Central Africaen_US
cg.howPublishedFormally Publisheden_US
cg.identifier.iitathemeBIOTECH & PLANT BREEDINGen_US
cg.identifier.urlhttp://hdl.handle.net/2078.1/thesis:49175en_US
cg.placeLouvain, Belgiumen_US
cg.subject.iitaAGRONOMYen_US
cg.subject.iitaBIODIVERSITYen_US
cg.subject.iitaCASSAVAen_US
cg.subject.iitaDISEASE CONTROLen_US
cg.subject.iitaFOOD SECURITYen_US
cg.subject.iitaPLANT BREEDINGen_US
cg.subject.iitaPLANT DISEASESen_US
cg.subject.iitaPLANT PRODUCTIONen_US
cg.subject.impactAreaNutrition, health and food securityen_US
cg.subject.impactPlatformNutrition, Health and Food Securityen_US
cg.subject.sdgSDG 2 - Zero hungeren_US
dc.contributor.authorLuzolo Tulomba, A.en_US
dc.date.accessioned2025-01-21T08:24:50Zen_US
dc.date.available2025-01-21T08:24:50Zen_US
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10568/169524en_US
dc.titleCaractérisation de la diversité génétique des bactéries Xanthomonas phaseoli pv. manihotis et Xanthomonas cassavae en RD Congoen_US
dcterms.abstractLe manioc est l'une des principales cultures en République Démocratique du Congo, malheureusement il est affecté par divers agents pathogènes. Cette étude a exploré la diversité génétique des souches de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) et Xanthomonas cassavae (Xc) en utilisant initialement la technique d'amplification de l'ARNr 16S pour confirmer l'identité des souches, puis la méthode MLVA (Multi-Locus Variable number tandem repeat Analysis) pour comparer les souches récentes aux anciennes souches du laboratoire SAVE, isolées en RD Congo dans les années 1970. La technique MLVA a permis de mettre en évidence la diversité au sein des souches comparées, tout en montrant certaines limites, notamment dans la comparaison des souches Lomami6 et UPB008, qui ont présenté des profils similaires. Le séquençage du génome entier de ces deux souches particulières a ensuite permis d'obtenir des informations plus précises. Les résultats ont confirmé que Lomami6 n'est pas une Xanthomonas cassavae, mais plutôt une Xanthomonas phaseoli pv. manihotis, tandis que UPB008 est effectivement une Xanthomonas cassavae. Par contre, aucun isolat de l’espèce Xanthomonas cassavae n’a pu être mise en évidence dans les souches récentes. Les résultats montrent que LOMAMI6 se rapproche de souches isolées en Colombie, au Nigeria et en Ouganda, tandis que UPB008 est génétiquement distinct des autres génomes de Xanthomonas cassavae déjà publiés sur la base des données NCBI. Les informations génomiques obtenues dans cette étude enrichissent notre compréhe...en_US
dcterms.accessRightsOpen Accessen_US
dcterms.audienceScientistsen_US
dcterms.bibliographicCitationLuzolo Tulomba, A. (2024). Caractérisation de la diversité génétique des bactéries Xanthomonas phaseoli pv. manihotis et Xanthomonas cassavae en RD Congo. Louvain, Belgium: Universite Catholique de Louvain, (74 p.).en_US
dcterms.descriptionIITA supervisor: Dr. M. Sikirouen_US
dcterms.extent74 p.en_US
dcterms.issued2024en_US
dcterms.languagefren_US
dcterms.licenseCC-BY-NC-4.0en_US
dcterms.publisherUniversite Catholique de Louvainen_US
dcterms.subjectcassavaen_US
dcterms.subjectgenetic diversityen_US
dcterms.subjectxanthomonas campestris phaseolien_US
dcterms.subjectdisease controlen_US
dcterms.subjectplant breedingen_US
dcterms.subjectplant diseasesen_US
dcterms.subjectplant productionen_US
dcterms.typeThesisen_US

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