Estudio de asociación del genoma completo para contenido de cianuro en clones de yuca

cg.authorship.typesCGIAR and advanced research instituteen_US
cg.contributor.affiliationInternational Center for Tropical Agricultureen_US
cg.contributor.affiliationCentre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique Pour le Développementen_US
cg.contributor.donorInternational Center for Tropical Agricultureen_US
cg.contributor.donorCGIAR Trust Funden_US
cg.contributor.initiativeAccelerated Breedingen_US
cg.coverage.countryColombiaen_US
cg.coverage.iso3166-alpha2COen_US
cg.coverage.regionAmericasen_US
cg.coverage.regionSouth Americaen_US
cg.coverage.regionLatin America and the Caribbeanen_US
cg.creator.identifierMaria A. Ospina: 0000-0001-9833-8592en_US
cg.creator.identifierAnestis Gkanogiannis: 0000-0002-6441-0688en_US
cg.creator.identifierLuis Londoño: 0000-0003-0384-6055en_US
cg.creator.identifierThierry Tran: 0000-0002-9557-3340en_US
cg.creator.identifierSandra M. Salazar: 0000-0002-0440-3240en_US
cg.creator.identifierJonathan Newby: 0000-0001-8088-5491en_US
cg.creator.identifierLuis Augusto Becerra Lopez-Lavalle: 0000-0003-3520-2270en_US
cg.subject.actionAreaGenetic Innovationen_US
cg.subject.alliancebiovciatCASSAVAen_US
cg.subject.impactAreaNutrition, health and food securityen_US
cg.subject.sdgSDG 1 - No povertyen_US
cg.subject.sdgSDG 2 - Zero hungeren_US
cg.subject.sdgSDG 3 - Good health and well-beingen_US
dc.contributor.authorOspina, Maria Alejandraen_US
dc.contributor.authorGkanogiannis, Anestisen_US
dc.contributor.authorLondoño, Luisen_US
dc.contributor.authorTran, Thierryen_US
dc.contributor.authorSalazar, Sandraen_US
dc.contributor.authorNewby, Jonathanen_US
dc.contributor.authorBecerra Lopez-Lavalle, Luis Augustoen_US
dc.date.accessioned2024-02-08T15:06:36Zen_US
dc.date.available2024-02-08T15:06:36Zen_US
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10568/139100en_US
dc.titleEstudio de asociación del genoma completo para contenido de cianuro en clones de yucaen_US
dcterms.abstractEl cultivo de yuca (Manihot esculenta Crantz) se considera de gran importancia para la seguridad alimentaria debido a que es la cuarta fuente de energía más importante para millones de personas de países tropicales. Un estudio de asociación de genoma completo (GWAS) se llevó a cabo para mapear loci de rasgos cuantitativos asociados con el contenido de cianuro en hojas y raíces de yuca un importante parámetro de calidad poscosecha, se utilizaron 230 genotipos de yuca con origen de diferentes países, una muestra representativa de la diversidad de germoplasma en la colección de yuca de CIAT. El estudio de GWAS utilizó 69.132 marcadores SNPs y un modelo MLM: PCA + K en el software TASSEL. Como resultado, se identificó que el contenido de HCN en las hojas de yuca varió de 538 ppm a 6181 ppm, mientras que en las raíces de yuca el contenido de HCN osciló desde 26 ppm a 1346 ppm. Se identificó una región genómica en el cromosoma 13 y 11 con cuatro SNPs significativamente asociados con el contenido de HCN. Una búsqueda en el genoma de la yuca ubicó estos SNPs en las cercanías de los genes Manes.13G079400, Manes.13G078400, Manes.13G084300, Manes.11G104200 y Manes.11G104100. Este estudio proporcionó información sobre la aplicación práctica de GWAS para diseccionar la base genética de los rasgos cuantitativos en la yuca. Los hallazgos presentados aquí ofrecen una base práctica para mejorar el contenido de HCN en la yuca a través de la selección Estudio de asociación del genoma completo para contenido de cianuro en clones asistida por marcadores y la selección genómica. Esta información es útil para ser aprovechada en el mejoramiento de genotipos de yuca que se adapten a los nuevos requerimientos de productividad futura, nutrición y el medio ambiente.en_US
dcterms.accessRightsLimited Accessen_US
dcterms.bibliographicCitationOspina, M.A.; Gkanogiannis, A.; Londoño, L..; Tran, T..; Salazar, S.; Newby, J.; Becerra Lopez-Lavalle, L.A. (2023) Estudio de asociación del genoma completo para contenido de cianuro en clones de yuca. In: Biotecnología productiva y sostenible. (Sharry, S. et al. (comps.)) Guadalajara, Jal. (Mexico); Centro de Investigación y Asistencia en Tecnología y Diseño del Estado de Jalisco A.C. p. 73-85. ISBN: 978-607-8734-57-3en_US
dcterms.extentp. 73-85en_US
dcterms.issued2023-12en_US
dcterms.languageesen_US
dcterms.licenseCopyrighted; all rights reserveden_US
dcterms.publisherCentro de Investigación y Asistencia en Tecnología y Diseño del Estado de Jalisco A.C.en_US
dcterms.subjectgenomesen_US
dcterms.subjectcassavaen_US
dcterms.subjectmandioca-yucaen_US
dcterms.subjectgenesen_US
dcterms.subjectsingle nucleotide polymorphismsen_US
dcterms.subjectcianurosen_US
dcterms.subjectcyanidesen_US
dcterms.subjectpolimorfismos de nucleótido únicoen_US
dcterms.typeBook Chapteren_US

Files