CIAT Genetic Resources Posters
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/10568/80741
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Item Procedimientos para el manejo de la calidad fitosanitaria en las colecciones internacionales de germoplasma(Poster, 2024-11-13) Cuervo, Maritza; Ramirez, Julio Cesar; Niño Jimenez, Diana Patricia; Gutierrez, Alejandro; Gonzalez, Laura; Muñoz, ChristianLos bancos de germoplasma desempeñan un papel clave en la conservación, la disponibilidad y el uso de la diversidad fitogenética para la mejora de los cultivos agrícolas para la seguridad alimentaria y nutricional; asegurando la disponibilidad de los recursos genéticos para el presente y las futuras generaciones. Los 11 bancos de germoplasma del CGIAR (Grupo Consultivo sobre Investigación Agrícola Internacional) conservan más de 760.000 accesiones de cereales, leguminosas forrajeras, especies arbóreas, cultivos de raíces y tubérculos y plátanos, representadas en 35 colecciones alrededor el mundo, conservadas en forma de: semilla, material in vitro y plantas vivas en campo o invernadero. En los últimos 10 años se han distribuido más de 864.000 accesiones a 160 países. Este movimiento global de germoplasma se debe realizar con total responsabilidad y sin correr el riesgo de diseminar enfermedades y plagas de importancia cuarentenaria. Para este fin, se han establecido en los centros internacionales, Unidades de Sanidad de Germoplasma (GHU) las cuales dentro de sus objetivos está el evitar la propagación de plagas cuarentenarias en la transferencia de germoplasma, prevenir brotes de plagas, salvaguardar la biodiversidad y fortalecer el desarrollo de las capacidades fitosanitarias. Las GHU realizan de forma rutinaria la evaluación de aproximadamente 340 plagas que son endémicas en los sitios de producción en África, Asia, Europa y Latinoamérica, incluidas bacterias, hongos, insectos, nematodos, oomicetos, fitoplasmas, virus y viroides. Estas evaluaciones de realizan mediante metodologías biológicas, morfológicas, taxonómicas, serológicas, bioquímicas y moleculares.Item Aplicación de la tecnología de secuenciación Oxford Nanopore Technologies para la confirmación de materiales de referencia bacterianos(Poster, 2024-11-13) Niño Jimenez, Diana Patricia; Gonzalez, Laura Juliana; Gutierrez, Alejandro; Muñoz, Christian; Ramirez, Julio Cesar; Cuervo, MaritzaEl banco de germoplasma de la Alianza Bioversity International y CIAT, conserva tres colecciones de importancia económica: frijol, forrajes tropicales y yuca. El banco conserva y distribuye el germoplasma, asegurando su calidad fitosanitaria con las pruebas de diagnóstico realizadas por la Unidad de Sanidad de Germoplasma (GHU), para detección de patógenos cuarentenarios como hongos, virus, bacterias y fitoplasmas. Los procesos de indexación son realizados siguiendo protocolos de diagnóstico previamente estandarizados y validados. En el caso específico de bacterias, el GHU cuenta con un conjunto de controles positivos (ácidos nucleicos y cepas) para diagnóstico que provienen de aislados propios y material de intercambio con laboratorios asociados. Corroborar la idoneidad de los controles positivos empleados en las pruebas moleculares es fundamental para confirmar la especificidad del diagnóstico. Por esta razón, se identificaron a nivel molecular aplicando la tecnología de secuenciación de Oxford Nanopore Technologies (ONT) para la obtención del genoma completo. Posteriormente se realizó el análisis bioinformático para el ensamblaje y anotación de las secuencias obtenidas. Para la identificación del género de las bacterias fitopatógenas, como referencia se utilizaron las secuencias del gen 16S rRNA desde las bases de datos del NCBI (National Center for Biotechnology Information). La secuenciación con ONT permitió la identificación molecular y, por lo tanto, la confirmación de las cepas conservadas por el GHU, mostrando cepas de especies pertenecientes a géneros tales como Xanthomonas, Curtobacterium, Burkholderia y Acidovorax, los cuales serán aplicados como controles internos para el diagnóstico de rutina aplicando metodologías moleculares como PCR o qPCR, además de contribuir este resultado con los requisitos de la norma en la documentación del material de referencia. Palabras clave: Indexación, material de referencia, ONT, PCR, qPCR.Item Evaluation of rootstocks for the multiplication of Phaseolus albicarminus Debouck & N. Chaves(Poster, 2023-12) Sabogal Carvajal, R; Gereda, J.M; Escobar Guzman, H; Santaella, M; Debouck, Daniel G.The wild bean P. albicarminus accession G40901 conserved in the Future Seeds germplasm bank (Palmira, Colombia) is currently not available because of lack of seeds for distribution. This living collection has been noted as susceptible to attacks of nematodes and root rots, putting the accession at risk.Item Propagation of Phaseolus albicarminus Debouck & N. Chaves, by layering, cuttings, and grafting.(Poster, 2023-12) Sabogal Carvajal, R.; Escobar Guzman, H.; Gereda, J.M.; Santaella, M.; Debouck, Daniel G.P. albicarminus, endemic to Costa Rica and a wild relative of cultivated beans, was collected in 2012 and described in 2020 by Debouck et al. The Future Seeds germplasm bank, located in Palmira, Colombia, safeguards one accession (G40901) of this little-known bean. The availability of original seeds of P. albicarminus is limited and production of new seeds has been scarce.Item Evaluación preliminar de tres tipos de injertos utilizados en la indización de yuca(Poster, 2000-10-01) Roa E, Julio César; Flor Payán, N.C.; Mafla, G.; Pineda López, Benjamín; Debouck, Daniel G.Item Produciendo germoplasma de fríjol, mediante injertos(Poster, 2022-11-07) Sabogal, Ramiro A.; Gereda, Javier Mauricio; Mestizo, Alvaro; Ypiales, Jeison; Rosero, Guillermo; Santaella, Marcela; Debouck, Daniel G.Item Phytosanitary certification of the Alliance of Bioversity International and CIAT germplasm health laboratory(Poster, 2022-08-06) Cuervo Ibáñez, Maritza; Ramírez Pretelt, Julio César; Niño, D.P.; Gutiérrez, A.; González, L.J.Plant Health 2022, Pittsburgh, Pennsylvania, USA. August 6-10, 2022.Item Análisis filogeográfico de la variación del ADN cloroplástico y la domesticación del fríjol común (Phaseolus vulgaris L.)(Poster, 2002) Chacón, Maria I.; Pickersgill, Barbara; Debouck, Daniel G.Item Observaciones sobre el estatuto de parientes silvestres del fríjol tépari: Phaseolus acutifolius Asa Gray(Poster, 2002) Muñoz, L.C.; Blair, Matthew W.; Debouck, Daniel G.Item Progress in seed production of Phaseolus albicarminus Debouck & N. Chaves, by use of grafting(Poster, 2021-12) Sabogal-Carvajal, Ramiro; Gereda, Javier Mauricio; Mestizo, Alvaro; Ypiales, Jeison; Santaella, Marcela; Debouck, Daniel G.Item Successful seed increase of Phaseolus chiapasanus Piper(Poster, 2021-12) Gereda, Javier Mauricio; Mestizo, Alvaro; Ypiales, Jeison; Sabogal, Ramiro; Santaella, Marcela; Santos, Luis G.; Debouck, Daniel G.Item Incremento exitoso de semillas de Phaseolus tuerckheimii Donnell-Smith(Poster, 2021-12) Sabogal-Carvajal, Ramiro; Mestizo, Alvaro; Ypiales, Jeison; Gereda, Javier Mauricio; Santaella, Marcela; Santos, Luis G.; Debouck, Daniel G.Item Phylogenetic patterns in the genus Manihot (Euphorbiaceae) inferred from a combined analysis of six DNA regions(Poster, 2008-07) Chacón, Juliana; Madriñán, Santiago; Debouck, Daniel G.; Tohme, Joseph M.Item Distribution of cassava germplasm from an international genebank: a service to the global agriculture(Poster, 2008) Mafla, Graciela; Roa, Julio C.; Flor, Norma C.; Aranzales Rondón, Ericson; Moreno, M.G.; Cuervo Ibáñez, Maritza; Debouck, Daniel G.Item Distribution of cassava germplasm from an international genebank: a service to the global agriculture(Poster, 2006) Mafla, Graciela; Roa, Julio C.; Flor, Norma C.; Aranzales Rondón, Ericson; Debouck, Daniel G.Item Is El Dorado green? Opportunities for the silicium revolution in Colombian landscapes?(Presentation, 2021-07-06) Debouck, Daniel G.Item Global diversity analysis identifies ample space for using CIMMYT and ICARDA’s wheat germplasm collections in breeding programs(Poster, 2018) Sansaloni, Carolina P.; Franco, Jorge; Santos, Bruno; Caccamo, Mario Jose; Singh, Sukhwinder; Petroli, Cesar; Payne, Thomas S.; Marshall, David; Kilian, Benjamin; Saint Pierre, Carolina; Kilian, Andrzej; Wenzl, Peter; Nawar, Mohamed; Sonder, Kai; Campos, Jaime; Vikram, P.; Pixley, KevinItem Genetic diversity within CIAT’s cassava germplasm collection(Poster, 2018) Santos, Bruno; Abdelhalim, Mohamed; Ruperao, Pradeep; Marshall, David; Wenzl, Peter; Dyer, SarahItem Item CIAT cassava in vitro collection cleaned against seedborne diseases of quarantine importance(Poster, 2001) Flor Payán, Norma C.; Pineda López, Benjamín; Mafla, Graciela